Будем собирать из исходников.

1. Сначала качаем пакет monodevelop 2.6.0.1 отсюда. Т.к. на сегодняшний момент для Ubuntu доступна только эта версия.

2. Потом ставим зависимые пакеты

sudo apt-get install libglade2-dev libart2.0-cil-dev libgnomevfs2-dev gnome-sharp2 libgnomecanvas2-dev libgnome2-dev libgnomeuimm-2.6-dev 
mono-complete gnome-sharp2

3. Распаковываем скачанный пакет monodevelop, внутри каталога выполняем

./configure --prefix=`pkg-config --variable=prefix mono`
make
sudo make install

4. Profit!